總腸道菌群檢測(cè)的樣本采集方式及標(biāo)準(zhǔn)化操作要求!
小楊 / 2025-12-03 09:58:38
百歐博偉生物:總腸道菌群檢測(cè)的樣本采集以糞便樣本為核心(是腸道菌群最直接的來(lái)源),部分特殊場(chǎng)景會(huì)輔以腸道黏膜樣本,不同采集方式有明確的標(biāo)準(zhǔn)化操作要求,具體如下:
一、核心采集方式:糞便樣本采集
糞便樣本采集是臨床和常規(guī)檢測(cè)中最常用的方式,根據(jù)檢測(cè)目的、樣本保存條件分為以下細(xì)分類型:
1、新鮮即時(shí)采集法
操作:使用無(wú)菌一次性糞便采集管(含采樣勺),采集排便后新鮮糞便的中段部分(避免接觸馬桶水、廁紙等污染物),采樣量根據(jù)檢測(cè)技術(shù)調(diào)整:16S rRNA 測(cè)序需≥10g,宏基因組測(cè)序需 15-20g,代謝產(chǎn)物檢測(cè)需 5-8g。
保存與運(yùn)輸:采集后立即旋緊采集管(部分采集管含 DNA 保護(hù)劑/保存液),室溫下可保存 24 小時(shí)(含保護(hù)劑),無(wú)保護(hù)劑時(shí)需 4℃冷藏且 2 小時(shí)內(nèi)送檢;長(zhǎng)期保存需 - 80℃凍存,冷鏈運(yùn)輸溫度波動(dòng)控制在 ±2℃內(nèi),運(yùn)輸時(shí)長(zhǎng)不超過(guò) 6 小時(shí)。
適用場(chǎng)景:常規(guī)菌群組成、功能基因檢測(cè),代謝產(chǎn)物定量分析。
2、居家采樣法(標(biāo)準(zhǔn)化套裝)
操作:使用商品化無(wú)菌采樣套裝(含采樣管、保存液、密封袋、冷鏈冰袋),按說(shuō)明書(shū)采集糞便樣本(采樣量≥5g),采樣后將樣本管密封放入密封袋,再置于冰袋中。
保存與運(yùn)輸:套裝含專用保存液時(shí),室溫可穩(wěn)定保存 72 小時(shí),冷藏可保存 7 天;運(yùn)輸時(shí)需通過(guò)冷鏈快遞,全程溫度監(jiān)控,確保送達(dá)實(shí)驗(yàn)室時(shí)樣本未解凍、未污染。
適用場(chǎng)景:大規(guī)模人群篩查、居家健康監(jiān)測(cè),是目前最普及的采樣方式。
3、多次采樣法
操作:針對(duì)菌群動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)需求,連續(xù) 3 天每日采集 1 次糞便樣本(每次≥5g),分別標(biāo)注采樣時(shí)間,單獨(dú)保存/運(yùn)輸。
保存與運(yùn)輸:同新鮮即時(shí)采集法,需嚴(yán)格區(qū)分各次樣本,避免混淆。
適用場(chǎng)景:評(píng)估益生菌/抗生素干預(yù)后的菌群變化、慢性腸病患者的長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)。
二、特殊采集方式:腸道黏膜樣本采集
僅用于臨床深度診療場(chǎng)景,需通過(guò)內(nèi)鏡操作完成,屬于侵入性采樣:
1、結(jié)腸鏡活檢采樣
操作:在結(jié)腸鏡檢查過(guò)程中,使用活檢鉗從結(jié)腸黏膜取 2-3 塊黏膜組織(每塊≥1mm³),立即放入無(wú)菌凍存管,加入 RNA/DNA 保護(hù)液。
保存與運(yùn)輸:-80℃凍存,干冰運(yùn)輸,運(yùn)輸時(shí)長(zhǎng)不超過(guò) 24 小時(shí)。
適用場(chǎng)景:炎癥性腸病的精準(zhǔn)分型、腸道黏膜相關(guān)菌群與疾病關(guān)聯(lián)研究。
2、小腸黏膜采樣
操作:通過(guò)小腸鏡或膠囊內(nèi)鏡輔助活檢,采集小腸黏膜組織(采樣量≥0.5mm³),處理方式同結(jié)腸鏡活檢樣本。
適用場(chǎng)景:小腸菌群失衡相關(guān)疾病的診斷。
3、采樣關(guān)鍵注意事項(xiàng)
采樣前 3-7 天需暫停服用抗生素、益生菌、益生元制劑,避免干擾菌群組成;若因臨床需求無(wú)法停藥,需在采樣記錄表中明確標(biāo)注用藥名稱、劑量、停藥時(shí)間。
采樣過(guò)程中全程無(wú)菌操作,避免手、衣物、環(huán)境等污染樣本;采樣管需清晰標(biāo)注姓名、采樣時(shí)間、采樣部位。
女性經(jīng)期、腹瀉/便秘急性期需暫緩采樣,待狀態(tài)穩(wěn)定后再采集,確保樣本能反映真實(shí)菌群狀態(tài)。
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