過去200年,有10億人因結(jié)核病(TB)而死亡。直到今天,結(jié)核病仍然是造成死亡人數(shù)最多的傳染病,WTO估計(jì)每年有1040萬新發(fā)結(jié)核病患者,每年有170萬人因結(jié)核病而死亡。此外,研究人員估計(jì)全球四分之一的人已經(jīng)被結(jié)核菌潛伏感染,從而成為潛在活動性結(jié)核病患者。
目前阻礙全球結(jié)核病防控的障礙有三個:
1、結(jié)核病的診斷在很大程度上仍然依賴于120年前所開發(fā)的、低靈敏度的涂片顯微鏡檢查技術(shù);
2、結(jié)核病的預(yù)防仍然依賴于100年前所開發(fā)的、效果有限的卡介苗(Bacille Calmette-Guérin, BCG);
3、結(jié)核病的治療仍然依賴于已有40至60年歷史、治療效果有限,并且抗藥性越來越嚴(yán)重的抗生素。
在這一背景下,多重耐藥性(multiple-drug resistance, MDR)和廣泛耐藥性(extensive-drug resistance, XDR)結(jié)核病已成為日益嚴(yán)重的問題。另外,結(jié)核病合并HIV感染和結(jié)核病合并型糖尿病等也都助長了結(jié)核病肆虐。
除了過時的診斷、預(yù)防和治療工具之外,各種教條主義也阻礙了結(jié)核病領(lǐng)域的發(fā)展。例如,一些科學(xué)家認(rèn)為耐藥結(jié)核菌對機(jī)體的適應(yīng)性不如藥物敏感菌株;一些觀點(diǎn)認(rèn)為結(jié)核菌作為一個物種,不同菌株之間并不存在基因型和表型的變異。人類結(jié)核病主要由結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)的成員引起。
MTBC是一組序列相似性非常高(>99%的核苷酸序列一致性)的抗酸桿菌。與其它細(xì)菌相比,MTBC成員間幾乎沒有序列變異,所以多位點(diǎn)序列分型的用途有限,因此MTBC成員之間的生態(tài)學(xué)和進(jìn)化關(guān)系仍有待進(jìn)一步探討。
新一代測序技術(shù)的發(fā)展可讓我們克服以往方法的局限性,在全基因組水平上觀察MTBC成員細(xì)菌的多樣性,從而詳細(xì)分析MTBC成員細(xì)菌多樣性的進(jìn)化推動力。
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