1，菌種，多是指國家指定的幾個(gè)菌種保藏中心的成品菌種，在液氮狀態(tài)下，盛放在安瓿管中。
企業(yè)生產(chǎn)按國家要求，必須要國家指定的菌保中心購買菌種，不得采用外來菌種。
一些分裝企業(yè)多選擇有擴(kuò)繁能力的企業(yè)生產(chǎn)的高濃度的成品菌劑，用以添加勾兌。比如說，可以選擇中國微生物菌種保藏中心的菌種。
2，菌種是指食用菌、工業(yè)菌、農(nóng)用菌菌絲體及其生長基質(zhì)組成的繁殖材料。菌種是從事微生物學(xué)及生命科學(xué)研究的基本材料，在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中，診斷制品的制備，菌苗的生產(chǎn)、微生物致病性研究，藥物的抑菌試驗(yàn)及藥品微生物檢驗(yàn)等都有一套完整的菌種菌種分為母種（一級種）、原種（二級種）和栽培種（三級種）三級。
用于發(fā)酵過程作為活細(xì)胞催化劑的微生物，包括細(xì)菌、放線菌、酵母菌和霉菌四大類。來源于自然界大量的微生物，從中經(jīng)分離并篩選出有用菌種，再加以改良，貯存待用于生產(chǎn)。