1、按照培養(yǎng)基的成分來分：培養(yǎng)基按其所含成分，可分為合成培養(yǎng)基、天然培養(yǎng)基和半合成培養(yǎng)基三類。
（1）合成培養(yǎng)基
合成培養(yǎng)基的各種成分完全是已知的各種化學(xué)物質(zhì)。這種培養(yǎng)基的化學(xué)成分清楚，組成成分精確，重復(fù)性強(qiáng)，但價(jià)格較貴，而且微生物在這類培養(yǎng)基中生長較慢。如高氏一號合成培養(yǎng)基、察氏（Czapek）培養(yǎng)基等。
（2）天然培養(yǎng)基
由天然物質(zhì)制成，如蒸熟的馬鈴薯和普通牛肉湯，前者用于培養(yǎng)霉菌，后者用于培養(yǎng)細(xì)菌。這類培養(yǎng)基的化學(xué)成分很不恒定，也難以確定，但配制方便，營養(yǎng)豐富，培養(yǎng)效果好，所以常被采用。
（3）半合成培養(yǎng)基
在天然有機(jī)物的基礎(chǔ)上適當(dāng)加入已知成分的無機(jī)鹽類，或在合成培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上添加某些天然成分，如培養(yǎng)霉菌用的馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基。這類培養(yǎng)基能更有效地滿足微生物對營養(yǎng)物質(zhì)的需要。
2、按照培養(yǎng)基的物理狀態(tài)分：培養(yǎng)基按其物理狀態(tài)可分為固體培養(yǎng)基、液體培養(yǎng)基和半固體培養(yǎng)基三類。
（1）固體培養(yǎng)基
是在培養(yǎng)基中加入凝固劑，有瓊脂、明膠、硅膠等。固體培養(yǎng)基常用于微生物分離、鑒定、計(jì)數(shù)和菌種保存等方面。用于微生物分離，鑒定，計(jì)數(shù)。如圖，微生物分離成菌落、菌苔。
（2）半固體培養(yǎng)基
是在液體培養(yǎng)基中加入少量凝固劑而呈半固體狀態(tài)?？捎糜谟^察細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)、鑒定菌種和測定噬菌體的效價(jià)等方面。用于觀察微生物運(yùn)動(dòng)特征。如圖，左側(cè)試管中微生物不運(yùn)動(dòng)，而右側(cè)試管中微生物運(yùn)動(dòng)，因而兩試管中現(xiàn)象不同。
（3）液體培養(yǎng)基
液體培養(yǎng)基中不加任何凝固劑。這種培養(yǎng)基的成分均勻，微生物能充分接觸和利用培養(yǎng)基中的養(yǎng)料，適于作生理等研究，由于發(fā)酵率高，操作方便，也常用于發(fā)酵工業(yè)。用于觀察微生物生長狀態(tài)。如圖，此例中左側(cè)為表面生長，右側(cè)為沉淀生長，中間兩個(gè)為均勻混濁生長。
3、按照微生物的種類分：培養(yǎng)基按微生物的種類可分為細(xì)菌培養(yǎng)基、放線菌培養(yǎng)基、酵母菌培養(yǎng)基和霉菌培養(yǎng)基等四類。
（1）常用的細(xì)菌培養(yǎng)基有營養(yǎng)肉湯和營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基。
（2）常用的放線菌培養(yǎng)基為高氏1號培養(yǎng)基。
（3）常用的酵母菌培養(yǎng)基有馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基和麥芽汁培養(yǎng)基。
（4）常用的霉菌培養(yǎng)基有馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基、豆芽汁蔗糖（或葡萄糖，葡萄糖比較昂貴）瓊脂培養(yǎng)基和察氏培養(yǎng)基等。
4、按照培養(yǎng)基用途分：培養(yǎng)基按其特殊用途可分為加富培養(yǎng)基、選擇性培養(yǎng)基和鑒別培養(yǎng)基。
（1）基礎(chǔ)培養(yǎng)基
是含有一般微生物生長繁殖所需基本營養(yǎng)物質(zhì)的培養(yǎng)基。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基是最常用的基礎(chǔ)培養(yǎng)基。
（2）加富培養(yǎng)基
是在基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入血、血清、動(dòng)植物組織提取液制成的培養(yǎng)基。用于培養(yǎng)要求比較苛刻的某些微生物。
（3）選擇培養(yǎng)基
是在普通培養(yǎng)基中加入特殊營養(yǎng)物質(zhì)或化學(xué)物質(zhì)，以抑制不需要的微生物的生長，有利于所需微生物的生長。用于將某種或某類微生物從混雜的微生物群體中分離出來。
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