RS瓊脂的應(yīng)用！百歐博偉生物
小楊 / 2021-01-14 08:37:36
一、背景
RS瓊脂用于氣單胞菌的分離培養(yǎng)。RS瓊脂中L-賴氨酸提供氨基酸，L-鹽酸鳥(niǎo)氨酸、L-半胱氨酸鹽提供氮源，麥芽糖提供碳源為可發(fā)酵的糖類(lèi)，硫代硫酸鈉和枸櫞酸鐵銨用于檢測(cè)硫化氫的產(chǎn)生，使菌落中心呈黑色，脫氧膽酸鈉抑制革蘭氏陽(yáng)性菌，氯化鈉維持均衡的滲透壓，酵母提取物提供碳源、氮源、維生素和生長(zhǎng)因子，新生霉素可提高抑菌性，溴麝香草酚蘭是指示劑，產(chǎn)酸時(shí)培養(yǎng)基由綠色變?yōu)辄S色，瓊脂是凝固劑。
氣單胞菌屬屬于氣單胞菌科，廣泛分布于自然界，可從水源、土壤以及人的糞便中分離。本屬細(xì)菌有的種可引起人類(lèi)和動(dòng)物腸炎、敗血癥等多種疾病。氣單胞菌屬屬于革蘭陰性短桿菌，大小為（1～4）μm×（0.1～1）/μm，菌體兩端鈍圓，單極鞭毛，運(yùn)動(dòng)極為活潑（除殺鮭氣單胞菌外）。無(wú)芽胞，有窄的莢膜。
氣單胞菌在血瓊脂上形成灰白、光滑、濕潤(rùn)、凸起直徑約2mm的菌落，多數(shù)菌株有β溶血環(huán)，3～5天后菌落呈暗綠色；在腸道選擇培養(yǎng)基上，大多數(shù)菌株形成乳糖不發(fā)酵菌落；在TCBS瓊脂上生長(zhǎng)不良；液體培養(yǎng)基中呈均勻混濁。
二、應(yīng)用
用于斑馬魚(yú)腸道菌群協(xié)同競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系對(duì)嗜水氣單胞菌感染的影響研究：
動(dòng)物腸道中存在著大量的微生物,在機(jī)體生長(zhǎng)發(fā)育,營(yíng)養(yǎng)代謝,免疫疾病等生物過(guò)程中扮演著重要的角色。隨著高通量測(cè)序和數(shù)據(jù)分析技術(shù)的快速發(fā)展,腸道微生物的研究進(jìn)入一個(gè)更深入的層次。
基因組測(cè)序結(jié)果表明正常動(dòng)物腸道攜帶著大量病原微生物,正常情況下并未表現(xiàn)出致病性,但在腸道菌群紊亂時(shí)表現(xiàn)出強(qiáng)烈致病性,表明細(xì)菌性疾病的的發(fā)生可能依賴于腸道菌群結(jié)構(gòu)組成和菌群之間的相互作用。
氣單胞菌作為一類(lèi)常見(jiàn)的淡水魚(yú)類(lèi)病原菌,是引起細(xì)菌性敗血病主要病因,每年給水產(chǎn)養(yǎng)殖造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。研究表明,氣單胞菌致病性受到外部環(huán)境的影響,而且氣單胞菌引起的敗血癥存在與其他腸道病原菌混合感染的現(xiàn)象,推測(cè)氣單胞菌感染依賴與腸道微生物的群落組成以及相互作用。
故本研究選用抗菌藥干擾腸道菌群并結(jié)合高通量測(cè)序以及網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù),來(lái)研究斑馬魚(yú)腸道菌群協(xié)同競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系對(duì)嗜水氣單胞菌感染的影響,研究結(jié)果如下：
1、抗菌藥對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群組成的影響斑馬魚(yú)腸道菌群主要由變形菌門(mén)(Proteobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、梭桿菌門(mén)(Fusobacteria)組成。甲硝唑處理(J組)以及聯(lián)合處理組(L組,甲硝唑、頭孢他啶、左氧氟沙星聯(lián)合處理)后的2、7天都能顯著改變腸道菌群組成,主要是提高變形菌門(mén)比例和降低厚壁菌門(mén)以及梭桿菌門(mén)的比例,抗菌藥處理后17天,甲硝唑處理以及聯(lián)合處理對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群組成以及β-多樣性與對(duì)照組(Z組)相比無(wú)顯著差異。
2、抗菌藥對(duì)斑馬魚(yú)腸道菌群網(wǎng)絡(luò)關(guān)系的影響抗菌藥能夠使菌群形成不同的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,對(duì)比對(duì)照組,甲硝唑處理和聯(lián)合處理,都增加了網(wǎng)絡(luò)圖的節(jié)點(diǎn)數(shù)(Z=329,J=361,L=571)以及連接數(shù)(Z=1123,J=1475,L=2781),使網(wǎng)絡(luò)關(guān)系變得更復(fù)雜。在17天時(shí),甲硝唑處理以及對(duì)照組的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系中存在更多的競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系(負(fù)/正連接數(shù)比,Z=0.21,J=0.32),而聯(lián)合處理組網(wǎng)絡(luò)關(guān)系中存在更多協(xié)同關(guān)系(負(fù)/正連接數(shù)比,L=0.02)。
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