支原體(Mycoplasma)是目前所能發(fā)現(xiàn)的能在無生命培養(yǎng)基中生長繁殖的最小的微生物。是一類無細胞壁的原核細胞型微生物,由于其能形成有分枝的長絲,故被稱之為支原體。支原體能導(dǎo)致人類和動物、植物疾病。
支原體菌種資源是微生物菌種資源的重要組成部分,與其他微生物菌種資源有著相似的共性描述內(nèi)容,又具其特殊性。本規(guī)范根據(jù)當前國家自然科技資源平臺建設(shè)的總體要求,結(jié)合支原體菌種資源的特點而制定,以實現(xiàn)支原體菌種資源描述信息的規(guī)范化,有利于支原體菌種資源的收集、保存、鑒定、評價、研究和利用,科學(xué)整理菌種資源,促進菌種資源信息化,實現(xiàn)菌種資源的高效共享和可持續(xù)利用。
1.1.1.4 支原體菌種資源描述規(guī)范
1 范圍
本標準規(guī)定了支原體菌種資源的描述內(nèi)容、描述要求。
本標準適用于支原體菌種資源的收集、整理和保存及數(shù)據(jù)庫和信息共享網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的建立。
2 規(guī)范性引用文件
下列文件中的條款通過本規(guī)范的引用而成為本規(guī)范的條款。凡是注明日期的引用文件,其隨后所有的修改單(不包括勘誤的內(nèi)容)或修訂版均不適用于本規(guī)范,然而,鼓勵根據(jù)本規(guī)范達成協(xié)議的各方研究是否可以使用這些文件的最新版本。凡是不注明日期的引用文件,其最新版本適用于本規(guī)范。
GB 19489-2004 實驗室 生物安全通用要求
國務(wù)院令第424號發(fā)布《病原微生物實驗室生物安全管理條例》
科技部自然科技資源平臺聯(lián)合管理辦公室文件《自然科技資源共性描述規(guī)范(試行)》
3 術(shù)語、定義、符號、縮寫語
1.2
支原體 Mycoplasma
是目前所能發(fā)現(xiàn)的能在無生命培養(yǎng)基中生長繁殖的最小的微生物。是一類無細胞壁的原核細胞型微生物。支原體屬于軟壁菌門(Tenericutes)、柔膜體綱(Mollicute)、支原體目(Mycoplasmatales)、支原體科(Mycoplasmataceae)、支原體屬?,F(xiàn)知有64個種。 對人致病的主要為肺炎支原體(M.pneumoniae)、人型支原體(M.hominis)和生殖器支原體(M.genitalium)。廣義的支原體還包括支原體科脲原體屬的解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum)。
1.3
支原體菌種資源 Mycoplasma culture collections
是指經(jīng)妥善保藏管理的支原體菌種實物及其相關(guān)信息
4 要求
4.1 對菌株的描述條款應(yīng)明確而無歧義,并且:
描述內(nèi)容應(yīng)清楚、準確、力求完整;
要充分考慮菌株的最新研究進展;
能被微生物專業(yè)人員理解。
4.2 描述要素
描述要素分為2類
5 M:必備要素,必須描述的要素。
6 O:可選要素,其描述與否視具體菌株而定。
7 描述內(nèi)容
對于支原體菌種資源的描述應(yīng)從資源基本信息、生態(tài)環(huán)境、形態(tài)學(xué)特征、培養(yǎng)特征、生理生化特性、細胞化學(xué)組分、遺傳學(xué)特性、功能特性等八個方面進行描述。數(shù)量性狀描述以計量單位表示,質(zhì)量性狀描述符按評價規(guī)范和等級劃分表示。
5.1 基本信息
5.1.1學(xué)名(M)
支原體在微生物分類學(xué)上的學(xué)名。
5.1.2中文名稱(M)
支原體的中文名稱。尚無中文譯名時,可暫時空缺。
5.1.3資源歸類編碼(M)
國家自然科技資源平臺資源分級歸類與編碼標準中的編碼。
5.1.4菌株保藏編號(M)
支原體在保藏機構(gòu)的保藏編號,由前綴和菌株編號兩部分組成。前綴,即保藏機構(gòu)名稱的縮寫,前綴和株菌編號之間不留空格。
5.1.5其它保藏機構(gòu)編號(O)
該支原體菌株在其他菌種保藏機構(gòu)中的菌株保藏編號,有兩個以上編號時,中間用分號隔開。
5.1.6生物安全等級(M)
描述衣原體的生物安全等級歸類:以生物安全一類、二類、三類、四類表示。
5.1.7編目收藏時間(O)
保藏機構(gòu)收集、按一定的規(guī)范編號建立菌種檔案并保存該菌株的時間。以yyyy-mm-dd表示。
5.1.8 來源歷史(M)
A.1 保藏單位得到該支原體菌株的途徑,轉(zhuǎn)移途徑以左指向箭頭連接。
5.1.9 提供者(O)
支原體菌種資源提供人/單位的名稱。
5.1.10 原始編號(O)
支原體菌株的最初分離編號。
5.1.11分離源(O)
該支原體菌株的分離源,宜指明具體的分離物質(zhì)和部位。
5.1.12原產(chǎn)國或地區(qū)(O)
支原體菌種采集地所在國家或地區(qū)名稱。
5.1.13采集地區(qū)(O)
分離采集地的行政區(qū)劃,詳細到縣。
5.1.14采集地點(O)
采集分離的具體地點。
5.1.15采集時間(O)
原始樣品的采集時間,用YYYY-MM-DD表示。
5.1.16培養(yǎng)基 (M)
適合支原體生長的營養(yǎng)物質(zhì) (包括添加的血清) 的名稱及統(tǒng)一編號。
5.1.17培養(yǎng)條件(M)
指適宜支原體菌株生長的溫度(以℃表示)、相對濕度、pH、厭氧和其它條件。
5.1.18 培養(yǎng)時間
支原體在特定培養(yǎng)條件下,生長至成熟(穩(wěn)定)所需要的時間,以h表示。
5.1.19模式菌株(M)
凡是模式菌株應(yīng)予指明。
5.1.20分類地位 (M)
應(yīng)指明每個菌株的界、門、綱、目、科、屬、種。
如需要,可指明該菌株的變種、亞種名稱等。
5.2 特征特性信息
5.2.1形態(tài)學(xué)特征
—— 細胞形狀 (M)
描述支原體顯微鏡下所觀察到的形狀,如球形、絲狀、環(huán)狀、星狀、顆粒狀和螺旋狀等。
—— 細胞大?。∕)
描述支原體細胞的大小,其大小其大小以直徑表示,單位為?m。
—— 莢膜(M)
描述支原體是否有莢膜。
5.2.2 培養(yǎng)特性
—— 培養(yǎng)條件(M)
描述培養(yǎng)條件是否需要加入人或動物血清。
—— 固體培養(yǎng)基上菌落大小 (M)
描述支原體在固體培養(yǎng)基上的菌落大小,通常以直徑表示,單位為 mm。
—— 固體培養(yǎng)基上菌落形狀(M)
描述菌落是呈典型的呈荷包蛋樣(中心稠厚,四周半透明,并常深入培養(yǎng)基內(nèi)),還是呈顆粒狀菌落。
—— 液體培養(yǎng)基中的渾濁度(M)
描述支原體在液體培養(yǎng)基中混濁度情況。
5.2.3 生化反應(yīng) (O)
描述支原體能否利用葡萄糖;能否水解精氨酸;能否水解尿素;是否需要膽固醇;能否還原四氮唑;能否吸附紅細胞。
5.2.4表面抗原分型
描述抗原分型基礎(chǔ)和所采用的方法及抗原分型結(jié)果。
5.2.5遺傳信息
支原體所含DNA和RNA的比值;支原體全部或部分基因序列;支原體基因組的堿基對數(shù)目,以kb表示。堿基鏈數(shù)目;堿基鏈存在方式 ;堿基鏈性質(zhì);開放閱讀框的數(shù)目和位置; G+Cmol%。
—— 核酸類型(M)
描述衣原體遺傳物質(zhì)的核酸類型,DNA/RNA。
—— 核酸序列 (0)
描述衣原體全部或部分基因序列。
—— 基因組大小(O)
描述衣原體基因組的堿基對數(shù)目,以kb表示。
—— 堿基鏈數(shù)目(M)
描述衣原體堿基鏈的數(shù)目。
—— 堿基鏈存在方式 (M)
描述堿基鏈存在方式。
—— 堿基鏈性質(zhì)(O)
描述堿基鏈的性質(zhì)。
—— 開放閱讀框的數(shù)目和位置(O)
描述衣原體開放閱讀框的數(shù)目和位置。
—— G+Cmol%
描述衣原體G+Cmol% 含量。
5.2.6 生物學(xué)特性
—— 自然宿主
—— 感染致病性或毒性
描述衣原體的感染性或毒性。
—— 胞外穩(wěn)定性
描述支原體胞外是否穩(wěn)定。
—— 流行季節(jié)(O)
支原體所致疾病與季節(jié)的關(guān)系。
—— 傳播方式(M)
描述包括經(jīng)飛沫、呼吸道傳播和直接(性)或間接接觸傳播等傳播方式。
—— 地理分布(O)
描述支原體所致疾病的地理分布。
—— 組織嗜性(M)
描述支原體的主要易感細胞和主要易感部位。
—— 對宿主致病的病理變化(O)
描述支原體對宿主致病的病理變化情況。
—— 對熱的抵抗力(0)
描述支原體對溫度的耐受程度
—— 消毒劑的敏感性(O)
描述支原體對消毒劑敏感的種類與敏感程度。
—— 對抗生素的敏感性(O)
描述支原體對抗生物敏感的種類與敏感程度。
5.2.7功能特性(0)
描述支原體菌種的主要用途。包括分類學(xué)、分析檢測、經(jīng)濟用途、環(huán)保、醫(yī)學(xué)、研究、教學(xué)等。
5.2 其它信息
5.2.1保藏方法(M)
保存支原體菌種資源采用的技術(shù)方法。包括液氮超低溫凍結(jié)、-80℃冰箱凍結(jié)、真空冷凍干燥、礦物油斜面、斜面等。