原籍乳酸菌是指在長(zhǎng)期進(jìn)化過程中，已根植于動(dòng)物腸黏膜中的乳酸菌類，其細(xì)胞往往一端定植于宿主黏膜上皮細(xì)胞表面和隱窩微生境內(nèi)的菌群(當(dāng)然絕大多數(shù)是原籍菌群)，與宿主的胃腸黏膜細(xì)胞有著極為密切的關(guān)系，其中常見的原籍乳酸菌有：雙岐乳桿菌、乳酸糞腸球菌、屎腸球菌、乳酸腸球菌等，
乳酸糞腸球菌是動(dòng)物腸道原籍菌之一，而目前市場(chǎng)上的飼料用微生物添加劑大多不是原籍菌，甚至不是乳酸菌（大多只是酵母菌和芽孢桿菌），而只有乳酸菌才是飼用微生物的真正主角菌，乳酸菌中又以原籍型乳酸菌最為重要。
原籍型乳酸菌有如下好處：
首先只有乳酸菌才是動(dòng)物腸黏膜中的常駐菌，或叫原籍菌，可定植于腸黏膜中，牢固地定植于腸道上皮細(xì)胞中，所帶來的養(yǎng)殖上的直接效益就是：
① 有定植功能的原籍乳酸菌添加劑，在飼料中的使用量極少，因?yàn)樗芏ㄖ灿谀c道上皮細(xì)胞，不會(huì)大量流失或隨著糞便排泄出來，甚至能在定植點(diǎn)不斷繁殖增長(zhǎng)，所以，所需要的添加量極少，以乳酸糞腸球菌為例，只要保證飼料中含活菌50萬個(gè)/克，即有非常好的效果。
② 原籍乳酸菌與動(dòng)物的相容性非常好，抗原性低，在飼料中的添加量是多多益善，不象其他非原籍益生菌，抗原性強(qiáng)，使用量過多反而會(huì)過度誘發(fā)抗體產(chǎn)生，浪費(fèi)免疫資源，無謂消耗飼料營(yíng)養(yǎng)；
③ 正是由于原籍乳酸菌與動(dòng)物腸道上皮細(xì)胞的牢固結(jié)合，從而排斥了病原菌附著點(diǎn)，在調(diào)節(jié)黏膜微生態(tài)平衡中起著更為重要的作用，并原位刺激動(dòng)物免疫系統(tǒng)的發(fā)育完善；
很多乳酸菌是人體和動(dòng)物體內(nèi)最重要的原籍菌，其中常見的原籍乳酸菌有：雙岐乳桿菌、乳酸糞腸球菌、屎腸球菌、乳酸腸球菌等，原籍乳酸菌是指在長(zhǎng)期進(jìn)化過程中，已根植于動(dòng)物腸黏膜中的乳酸菌類，其細(xì)胞往往一端定植于宿主黏膜上皮細(xì)胞表面和隱窩微生境內(nèi)的菌群(當(dāng)然絕大多數(shù)是原籍菌群)，與宿主的胃腸黏膜細(xì)胞有著極為密切的關(guān)系；
反之，芽孢桿菌和酵母菌均沒有定植功能。
④：也只有原籍乳酸菌才能在腸黏膜上形成天然乳酸菌保護(hù)屏障，抵御外來侵害；
原籍乳酸菌在腸道上皮細(xì)胞定植后，連成一片，從而可形成腸黏膜保護(hù)屏障膜，腸黏膜是還是飼料中抗原（細(xì)菌、病毒、寄生蟲及霉菌毒素）入侵身體的初始位置，所以黏膜系統(tǒng)是抵抗病原的第一道防線，其上密布各種淋巴組織、派亞氏腺體及免疫細(xì)胞等，所以黏膜系統(tǒng)是執(zhí)行特異性免疫的重要場(chǎng)所。
糞腸球菌可以腸黏膜表面形成一層保護(hù)屏障，牢固地占據(jù)腸黏膜的定植點(diǎn)，從而競(jìng)爭(zhēng)性地抑制有害細(xì)菌或病原菌的侵害，同時(shí)，分泌肽類生物抗菌素，抑制病原菌的繁殖生長(zhǎng)，乳酸糞腸球菌由于含有和致病性糞腸球菌或大腸桿菌相類似的細(xì)胞壁成分，所以，可強(qiáng)烈激發(fā)動(dòng)物機(jī)體產(chǎn)生免疫抗體，增強(qiáng)免疫功能，刺激免疫反應(yīng)，提高動(dòng)物的抗病力。
反之非原籍菌（即目前市場(chǎng)上的主流直接飼用微生物產(chǎn)品，芽孢桿菌和酵母菌為主）由于定植能力差，無法形成有效屏障膜，但可以刺激免疫系統(tǒng)產(chǎn)生抗體作用。