常見(jiàn)真菌:酵母菌,霉菌,還有香菇、草菇、金針菇等大型真菌
常見(jiàn)細(xì)菌:大腸桿菌,枯草芽孢桿菌,乳酸菌,硝化細(xì)菌,根瘤菌,金黃色葡萄球菌 這是一種原核生物，新陳代謝屬異養(yǎng)厭氧型 它能夠?qū)⑷樘峭ㄟ^(guò)無(wú)氧呼吸轉(zhuǎn)化成乳酸因此通常被人們拿來(lái)做為做酸奶的重要材料
藍(lán)藻 ；這是一種很罕有的種類，但并不是它的數(shù)量而是它的特性，它是不多見(jiàn)的自養(yǎng)需氧型的原核生物，地球上最初的大氣中的氧氣就是它首先合成的
它也是不多有的一種不存在葉綠體卻能夠進(jìn)行光合作用的生物，并且它還能夠固氮，是地球初期生命能夠穩(wěn)定發(fā)展的功臣
固氮菌；這是生物圈中氮的循環(huán)不可缺少的一環(huán)，它是一種異養(yǎng)需氧的原核生物。它們固定空氣中的氮形成氨根供動(dòng)植物使用，大家眾所周知氮元素是生命體現(xiàn)者——蛋白質(zhì)的重要組成元素，而生物所用的氮元素有百分之八十是固氮菌，可見(jiàn)固氮菌之重要。
硝化細(xì)菌；這也是微生物世界不可少的一員也是生物圈不可少的一員，它是一種自養(yǎng)需氧型的原核生物，而且它進(jìn)行的自養(yǎng)功能也是十分獨(dú)特的化能合成，它通過(guò)將土壤中的氨根氧化成硝酸根而獲得自身能量，也是生物圈中氮的循環(huán)不可缺少的一環(huán)，因?yàn)橐话愎痰潭ǖ牡且园备嬖诘亩话阒参餆o(wú)法直接吸收氨根，而要通過(guò)它的轉(zhuǎn)化成硝酸根后才能吸收
說(shuō)了硝化細(xì)菌就不能不說(shuō)氮循環(huán)圈中另外一員，反硝化細(xì)菌，這是一種厭氧異養(yǎng)的微生物，在土壤缺氧的情況下它會(huì)將硝酸根分解成壓硝酸根，而亞硝酸根很不穩(wěn)定會(huì)分解成氮?dú)饣貧w大氣。
下面說(shuō)一種真菌：大家最常見(jiàn)的酵母菌，這是一種兼性厭氧的異養(yǎng)的生物，日常生活中大家一定常見(jiàn)到它的身影，它在無(wú)氧情況下會(huì)將糖類分解成酒精跟CO2在有氧情況下會(huì)快速繁殖因而被廣泛運(yùn)用與酒釀造業(yè)與糕點(diǎn)的發(fā)酵
真菌界
* 真菌：蟲(chóng)道真菌，水生真菌，糞生真菌，昆蟲(chóng)寄生真菌，霉菌，捕食性真菌，污水真菌，土壤真菌，海洋真菌，藥用真菌，菌根等。
* 粘菌門：集孢粘菌綱，粘菌綱，根腫菌綱等。
* 鞭毛菌亞門：壺菌綱，絲壺菌綱，卵菌綱（水節(jié)霉目、霜霉目、水霉目）等。
* 接合菌亞門：接合菌綱、毛霉目、蟲(chóng)霉目，毛菌綱
* 子囊菌亞門：半子囊菌綱（內(nèi)孢霉目、外囊菌目，不整囊菌綱、散囊菌目，核菌綱、白粉菌目、小煤炱目、球殼目，腔菌綱、多腔菌目、座囊菌目、半球腔菌目，蟲(chóng)囊菌綱），盤菌綱（塊菌目、盤菌目）等
* 擔(dān)子菌亞門：冬孢菌綱、銹菌目、黑粉菌目，層菌綱（銀耳目、木耳目、隔擔(dān)菌目、外擔(dān)菌目、多孔菌目、傘菌目），腹菌綱（鬼筆目、馬勃菌目、鳥(niǎo)巢菌目、硬皮馬勃目、柄灰包目）等。
* 半知菌亞門：絲孢綱，腔孢綱等。
* 真菌門 * 地衣
細(xì)菌界
* 芽生細(xì)菌：螺菌科，假單胞菌科，固氮菌科，根瘤菌科，甲基單胞菌科，腸桿菌科，柄桿菌屬科，硫細(xì)菌，鞘細(xì)菌，弧菌科，擬桿菌科，奈瑟氏菌科，韋榮氏球菌科，硝化桿菌科，鐵細(xì)菌，鞘鐵細(xì)菌科，甲烷桿菌科，微球菌科，鏈球菌科，消化球菌科，芽孢桿菌科，乳桿菌科，棒狀菌群，丙酸桿菌科
* 放線菌：放線菌科，公枝桿菌科，諾卡氏菌科，嗜皮菌科，弗蘭克氏菌科，小單孢菌科，高溫放線菌科，高溫單胞菌科，小莢孢囊菌科，小多胞菌科，鏈霉菌科，魚(yú)孢菌科，流動(dòng)放線菌科，枝桿菌科，嗜熱放線菌科等。
1、真菌通常又分為三類，即”酵母菌“、“霉菌”和“蕈菌”（大型真菌）
2、酵母菌：是一些單細(xì)胞真菌，并非系統(tǒng)演化分類的單元。一種肉眼看不見(jiàn)的微小單細(xì)胞微生物，能將糖發(fā)酵成酒精和二氧化碳，分布于整個(gè)自然界，是一種典型的兼性厭氧微生物，在有氧和無(wú)氧條件下都能夠存活，是一種天然發(fā)酵劑。
3、霉菌：是絲狀真菌的俗稱，意即"發(fā)霉的真菌"，它們往往能形成分枝繁茂的菌絲體，但又不象蘑菇那樣產(chǎn)生大型的子實(shí)體。在潮濕溫暖的地方，很多物品上長(zhǎng)出一些肉眼可見(jiàn)的絨毛狀、絮狀或蛛網(wǎng)狀的菌落，那就是霉菌。
4、蕈菌：英語(yǔ)中的mushroom是一個(gè)多義詞，作為生物名稱通常譯作蘑菇，是指擔(dān)子菌中的那些傘菌，特別是雙孢菇中的白蘑菇。mushroom還有一個(gè)更廣義的解釋，指能形成大型肉質(zhì)子實(shí)體的真菌，與macrofungi 同義，這一語(yǔ)義按照國(guó)際知名學(xué)者張樹(shù)庭的建議譯作蕈菌。